技術(shù)文章
Technical articles美國Prospect Biosystems, Inc.公司發(fā)明的Edge?200氣動密度超速分離系統(tǒng), 是一種易于操作、壓縮空氣驅(qū)動的臺式超離系統(tǒng),可實現(xiàn)強化密度離心分離。突破性的Edge技術(shù)采用的是分步密度梯度分離的方式,其分離溶液的濃度逐步增加, 提供了一個快速的,以生物學的變化為基本的,簡化組織和細胞復雜成分的分離分組新方法。從而為生物標志物研發(fā),臨床診斷,及外科病理學提供了一個有力的工具和技術(shù)平臺。
Edge技術(shù)在不同生物學分析流程中的應(yīng)用
與其它蛋白分析技術(shù)相配合
應(yīng)用領(lǐng)域
1.低豐度蛋白的分離和富集
◆Edge 技術(shù)能夠保持被分離組織或細胞亞結(jié)構(gòu)分區(qū)的完整性
◆降低原樣品中成分的復雜性獲得樣品的濃縮和富集,大幅度增加在下游2-D膠上被檢測到的機率
◆加快靶蛋白濃度的鑒定速度,推進靶蛋白與亞細胞分區(qū)相互關(guān)系的研究
應(yīng)用范例:分離分組大鼠肝臟的去細胞核勻漿上清液
2.尋找和發(fā)現(xiàn)生物標記物
◆Edge 技術(shù)和 Edge200 分離系統(tǒng)與其它傳統(tǒng)蛋白分析技術(shù),如蛋白轉(zhuǎn)印, 2D膠電泳和質(zhì)譜相結(jié)合, 提供了一個快速有效的鑒定通路生物標志物及相關(guān)變化的生物網(wǎng)路系統(tǒng)。
◆Edge 技術(shù)融合了該公司的評估潛在生物標記物的統(tǒng)計算法,該技術(shù) (受保護)基于生物標記物的相對百分比分布,為進一步的臨床驗證提供更多的數(shù)據(jù)和機會。
應(yīng)用范例:內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)和糖尿病關(guān)系的研究中,在分組樣品中用已知生物途徑標志物如IRE1為探針,有可能同時發(fā)現(xiàn)新的與該途徑相關(guān)的其他生物標志物。
3.不同的亞細胞結(jié)構(gòu)分區(qū)內(nèi)生物信息和其變化的研究
應(yīng)用范例:Edge 200可以用來研究在誘導I型糖尿病時T 細胞改變過程中,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶蛋白和其他熱休克蛋白家族成員的作用。
4.生物標志物的評價和驗證
◆Edge 技術(shù)融合了Prospect公司的評估潛在生物標記物的統(tǒng)計算法,該技術(shù)(受保護)基于生物標記物的相對百分比分布,為進一步的臨床驗證提供更多的數(shù)據(jù)和機會。
應(yīng)用范例:突觸功能障礙標記物p-synapsinI和氧化應(yīng)激標記物GRP75作標記物在大鼠大腦和心臟中的表達對比研究
5.營養(yǎng)蛋白組學
應(yīng)用范例:葉酸缺乏和氧化應(yīng)激
◆Edge 技術(shù)與2D LC-MS/MS技術(shù)相結(jié)合可以用于葉酸缺乏和正常組大鼠肝臟之間低豐度生物標志蛋白的定量分析比較。這項綜合技術(shù)既快速又可承擔大樣品量的分析任務(wù)。
◆Edge 密度萃取法與其它傳統(tǒng)的蛋白譜分析技術(shù),蛋白轉(zhuǎn)印,2D電泳和質(zhì)譜相結(jié)合提供了一個快速的蛋白組學究方法,從而可以充分理解葉酸缺乏同時對大鼠大腦和肝臟的影響以及相應(yīng)亞細胞水平上蛋白變化之間的生物學。
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